Como tudo na natureza, o pênis passa por várias mudanças durante a vida. Cada fase é controlada principalmente pelos níveis de testosterona. Algo em torno dos 9-15 anos, a glândula pituitária libera hormônios que dizem para o corpo começar a produzir a testosterona. A puberdade começa e traz mudanças. Os testículos, escroto, pênis e pelos pubianos começam a crescer. Os níveis de testosterona têm seu pico no final da adolescência e começo dos 20 anos. A quantidade de testosterona no corpo pode cair ligeiramente no final dos 20 anos até os 40, mas a mudança é mínima.
Após os 40 anos, os níveis totais podem cair um pouco. Mas, o corpo lentamente começa a fazer mais de uma proteína chamada de (SHBG). Ela se liga à testosterona no sangue e diminui a sua quantidade disponível para uso pelo corpo. Conforme os níveis de testosterona caem, o homem pode começar a perceber outras mudanças como afinamento de pelos corporais, inclusive os pubianos, e eles ficam grisalhos. O tamanho do pênis pode não parecer tão largo como era. O seu formato, para um pequeno numero de homens, pode ficar curvado. Isso pode afetar seu tamanho, rigidez e função.
Os testículos dentro do escroto existem principalmente para produzir o esperma. Conforme os níveis de testosterona caem, a produção de esperma diminui e eles encolhem. Conforme o homem fica mais velho, os músculos do pênis não trabalham tão bem e, o escroto fica em uma posição mais relaxada. Os nervos do pênis ficam menos sensíveis com o envelhecimento. Isso pode causar problemas com a ereção e o orgasmo. Conforme os níveis de testosterona caem, a disfunção erétil pode aparecer. O homem pode perder a rigidez, mas não necessariamente a habilidade de manter uma vida sexual ativa. Atualmente, já existem muitos tratamentos eficazes para a disfunção erétil.

